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陣亡將士身份辨認(rèn)正推動新一代DNA測序技術(shù)突破

本文作者: 大壯旅 2016-07-22 19:00
導(dǎo)語:新一代測序技術(shù)未來將取代使用了三十年之久的“桑格測序(NGS)”

陣亡將士身份辨認(rèn)正推動新一代DNA測序技術(shù)突破

越南戰(zhàn)爭后,美國和越南政府一直在進(jìn)行失蹤和陣亡士兵遺體的搜尋工作。1998年,美國專家通過DNA測試發(fā)掘并辨認(rèn)了最后一名失蹤美國士兵,但對于越南一方來說,等待辨認(rèn)的士兵人數(shù)還有30萬之巨,此外還有無以計(jì)數(shù)的平民尸骸不知葬身何處。

“戰(zhàn)爭已經(jīng)過去幾十年了,許多參戰(zhàn)士兵的親屬都正在老去,”越南科學(xué)技術(shù)研究院主管說道?!耙虼?,我們辨認(rèn)遺骨,讓亡魂得以安息的工作需要加快了?!?/p>

為了完成這項(xiàng)任務(wù),越南政府還專門擬定了Project 150計(jì)劃,投資5000億越南盾(約合2500萬美元)升級了本地DNA測試實(shí)驗(yàn)室的設(shè)施,準(zhǔn)備在2020年前辨認(rèn)出至少70000名越南陣亡士兵的遺骸。據(jù)悉,這些升級后的設(shè)施將于今年年底正式投入使用。

新一代DNA測序技術(shù)(NGS)

如果該計(jì)劃推進(jìn)順利,就能向世界展示先進(jìn)的測序技術(shù)在取證領(lǐng)域的巨大作用。據(jù)悉,新一代測序技術(shù)未來將取代使用了三十年之久的“桑格測序(NGS)”,利用該技術(shù),越南的科學(xué)家可以從那些已經(jīng)被破壞嚴(yán)重的遺骸中獲取必要的信息。

近些年來,NGS技術(shù)已經(jīng)發(fā)生了翻天覆地的變化,在測序通量突飛猛進(jìn)的同時(shí),測序成本直線下降。2014年Illumina 公司發(fā)布的新型測序系統(tǒng)已經(jīng)可以用千元成本測序完整的人類基因組,最多每天能測序 6000億個(gè)堿基對。

而要完成這項(xiàng)計(jì)劃,科學(xué)家們首先要建立一個(gè)數(shù)據(jù)庫,這里會存儲超過100萬越南人的生物樣本,包括唾液、頭發(fā)和血液。未來,這些樣本會成為“參考數(shù)據(jù)庫”,科學(xué)家可以通過DNA比對算法找到死者與數(shù)據(jù)庫中樣本的聯(lián)系,以便確認(rèn)其家人。不過這一過程可不簡單,通常要識別一個(gè)陣亡士兵的身份,需要比對3-6個(gè)相似的參考樣本。

除了DNA辨認(rèn),有時(shí)越南政府還會讓家屬參與現(xiàn)場辨認(rèn)。畢竟某些配飾、記號和歷史痕跡證據(jù)也非常重要。

但其實(shí)影響DNA存留的因素很多,其中就包括溫度和時(shí)間。穴居人的骨頭在恒溫恒濕的穩(wěn)定環(huán)境中可以存儲數(shù)萬年,但越南的潮濕悶熱氣候卻無法提供這種環(huán)境,殘骸中DNA的降解速度非??臁R虼?,僅靠組織樣本來辨別陣亡士兵身份已經(jīng)變得不太可行。所有,他們需要和其他技術(shù)公司進(jìn)行合作,其中就包括醫(yī)學(xué)診斷數(shù)據(jù)庫巨頭Bioglobe和國際失蹤人員委員會(ICMP)。

Bioglobe已經(jīng)與歐洲測序公司QIAGEN達(dá)成了合作,它們將幫助科學(xué)家處理那些已經(jīng)被土壤中微生物污染過的骨頭和牙齒(DNA存留明顯變少)。ICMP則主要負(fù)責(zé)遺骸挖掘階段的指導(dǎo),這樣就能避免越南科學(xué)家將不同的骨頭弄混。此外,ICMP在性別區(qū)分上還非常有一手。

NGS的廣泛應(yīng)用前景

在下一代測序技術(shù)不斷進(jìn)步的同時(shí),它的應(yīng)用也越來越廣泛。據(jù)該領(lǐng)域?qū)<医榻B,下一代測序在臨床領(lǐng)域的應(yīng)用快速增漲。研究數(shù)據(jù)顯示,新一代測序市場將于2020年達(dá)到48.92億美元,復(fù)合年增長率達(dá)到20.7%。

在應(yīng)用類型上,NGS市場可劃分為腫瘤研究、遺傳篩查、傳染病研究、藥物和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、分子流行病學(xué)、農(nóng)業(yè)和其他方面的應(yīng)用。

據(jù)悉,越來越多的研究者選擇下一代測序的多基因panel對腫瘤進(jìn)行研究,或者通過外顯子測序鑒定潛在的藥物靶點(diǎn)。在診斷兒童遺傳學(xué)疾病時(shí),人們也逐漸拋開了傳統(tǒng)的診斷方法,轉(zhuǎn)而使用全外顯子組測序。

此外,NGS檢測有兩大優(yōu)勢,它既可以幫助人們確定治療方案,也可以為患兒父母評估他們未來子女患同樣疾病的風(fēng)險(xiǎn)。實(shí)際上,用下一代測序進(jìn)行(致病基因)攜帶者篩查,是NGS 的“殺手锏”。

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