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陣亡將士身份辨認正推動新一代DNA測序技術突破

本文作者: 大壯旅 2016-07-22 19:00
導語:新一代測序技術未來將取代使用了三十年之久的“桑格測序(NGS)”

陣亡將士身份辨認正推動新一代DNA測序技術突破

越南戰(zhàn)爭后,美國和越南政府一直在進行失蹤和陣亡士兵遺體的搜尋工作。1998年,美國專家通過DNA測試發(fā)掘并辨認了最后一名失蹤美國士兵,但對于越南一方來說,等待辨認的士兵人數還有30萬之巨,此外還有無以計數的平民尸骸不知葬身何處。

“戰(zhàn)爭已經過去幾十年了,許多參戰(zhàn)士兵的親屬都正在老去,”越南科學技術研究院主管說道?!耙虼?,我們辨認遺骨,讓亡魂得以安息的工作需要加快了?!?/p>

為了完成這項任務,越南政府還專門擬定了Project 150計劃,投資5000億越南盾(約合2500萬美元)升級了本地DNA測試實驗室的設施,準備在2020年前辨認出至少70000名越南陣亡士兵的遺骸。據悉,這些升級后的設施將于今年年底正式投入使用。

新一代DNA測序技術(NGS)

如果該計劃推進順利,就能向世界展示先進的測序技術在取證領域的巨大作用。據悉,新一代測序技術未來將取代使用了三十年之久的“桑格測序(NGS)”,利用該技術,越南的科學家可以從那些已經被破壞嚴重的遺骸中獲取必要的信息。

近些年來,NGS技術已經發(fā)生了翻天覆地的變化,在測序通量突飛猛進的同時,測序成本直線下降。2014年Illumina 公司發(fā)布的新型測序系統(tǒng)已經可以用千元成本測序完整的人類基因組,最多每天能測序 6000億個堿基對。

而要完成這項計劃,科學家們首先要建立一個數據庫,這里會存儲超過100萬越南人的生物樣本,包括唾液、頭發(fā)和血液。未來,這些樣本會成為“參考數據庫”,科學家可以通過DNA比對算法找到死者與數據庫中樣本的聯系,以便確認其家人。不過這一過程可不簡單,通常要識別一個陣亡士兵的身份,需要比對3-6個相似的參考樣本。

除了DNA辨認,有時越南政府還會讓家屬參與現場辨認。畢竟某些配飾、記號和歷史痕跡證據也非常重要。

但其實影響DNA存留的因素很多,其中就包括溫度和時間。穴居人的骨頭在恒溫恒濕的穩(wěn)定環(huán)境中可以存儲數萬年,但越南的潮濕悶熱氣候卻無法提供這種環(huán)境,殘骸中DNA的降解速度非常快。因此,僅靠組織樣本來辨別陣亡士兵身份已經變得不太可行。所有,他們需要和其他技術公司進行合作,其中就包括醫(yī)學診斷數據庫巨頭Bioglobe和國際失蹤人員委員會(ICMP)。

Bioglobe已經與歐洲測序公司QIAGEN達成了合作,它們將幫助科學家處理那些已經被土壤中微生物污染過的骨頭和牙齒(DNA存留明顯變少)。ICMP則主要負責遺骸挖掘階段的指導,這樣就能避免越南科學家將不同的骨頭弄混。此外,ICMP在性別區(qū)分上還非常有一手。

NGS的廣泛應用前景

在下一代測序技術不斷進步的同時,它的應用也越來越廣泛。據該領域專家介紹,下一代測序在臨床領域的應用快速增漲。研究數據顯示,新一代測序市場將于2020年達到48.92億美元,復合年增長率達到20.7%。

在應用類型上,NGS市場可劃分為腫瘤研究、遺傳篩查、傳染病研究、藥物和生物標志物發(fā)現、分子流行病學、農業(yè)和其他方面的應用。

據悉,越來越多的研究者選擇下一代測序的多基因panel對腫瘤進行研究,或者通過外顯子測序鑒定潛在的藥物靶點。在診斷兒童遺傳學疾病時,人們也逐漸拋開了傳統(tǒng)的診斷方法,轉而使用全外顯子組測序。

此外,NGS檢測有兩大優(yōu)勢,它既可以幫助人們確定治療方案,也可以為患兒父母評估他們未來子女患同樣疾病的風險。實際上,用下一代測序進行(致病基因)攜帶者篩查,是NGS 的“殺手锏”。

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