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如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

本文作者: 汪思穎 2017-09-19 15:21
導語:如何通過消除Tensorflow的網絡瓶頸,實現Tensorflow多機并行線性加速?

雷鋒網 AI科技評論按:本文作者王佐,文章首發(fā)于其知乎主頁,AI科技評論獲其授權轉載。

在上一家公司就開始實踐打磨一個深度優(yōu)化的深度學習系統(tǒng),當時從消除網絡瓶頸,非凸優(yōu)化,以及具體的深度學習算法等方面基于PaddlePaddle做了許多工作。目前公司主要深度學習算法都是跑在Tensorflow上,使用配置了GeForce GTX 1080的單機訓練,一次完整的訓練至少需要一周的時間,所以決定從優(yōu)化Tensorflow多機并行方面提高算力。

  • 為什么要優(yōu)化Tensorflow多機并行

更多的數據可以提高預測性能[2],這也意味著更沉重的計算負擔,未來算力將成為AI發(fā)展的最大瓶頸。在大數據時代,解決存儲和算力的方法是Scale out,在AI時代,Scale out也一定是發(fā)展趨勢,并且大數據分析任務和AI/ML任務會共享處理設備(由于AI/ML迭代收斂和容錯的特征,這兩種任務未來不太可能使用統(tǒng)一平臺),所以需要在分布式環(huán)境下優(yōu)化資源配置[3],消除性能瓶頸。雖然現在Tensorflow能支持多機并行分布式訓練,但是針對復雜網絡,其訓練速度反而不如單臺機器[1]。目前已經有IBM[4]和Petuum[1]分別在其深度學習系統(tǒng)PowerAI 4.0和Poseidon中實現多機并行線性加速,本文介紹我如何通過消除Tensorflow的網絡瓶頸,實現Tensorflow多機并行線性加速。

  • Tensorflow分布式訓練的網絡瓶頸分析

深度學習訓練需要海量的數據,這就需要超大規(guī)模參數的網絡模型擬合。如果訓練數據不足,會造成欠擬合;如果網絡模型參數太少,只會得到低精度的模型。目前常見網絡模型參數已經上億,參數大小達到數GB。[10]中給出了訓練數據和參數大小一些例子。

訓練數據和參數大?。▉碜訹10])

如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

目前GPU已經成為深度學習訓練的標配。GPU具有數量眾多計算單元和超長流水線,并且具備強大并行計算能力與浮點計算能力,可以大幅加速深度學習模型的訓練速度,相比CPU能提供更快的處理速度、更少的服務器投入和更低的功耗。這也意味著,GPU集群上訓練深度學習模型,迭代時間更短,參數同步更頻繁。[9]中對比了主流深度學習系統(tǒng)在CPU和GPU上的訓練性能,可以看出GPU每次迭代的時間比CPU少2個數量級。

CPU訓練alexnet(來自[9])

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GPU訓練alexnet(來自[9])

如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

假設每0.5秒一個迭代,每個worker每秒需要通過網絡傳輸的大于4GB,即使使用10GbE,參數同步也會瞬間把網絡占滿??紤]到訓練數據可能通過NFS或者HDFS加載,也會占用很多網絡帶寬。在一個數據分析任務和AI/ML任務混合的環(huán)境中,大數據分析任務也會消耗很多網絡帶寬(如shuffle操作),網絡延遲會更加嚴重。所以如果想以Scale out的方式提升算力,網絡將是最大的瓶頸。[1]中通過實驗證明,在8個節(jié)點進行Tensorflow分布式訓練,對于VGG19網絡,90%的時間花在等待網絡傳輸上面。

網絡開銷(來自[2])

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  • 消除網絡瓶頸的方法(一)

分布式深度學習可以采用BSP和SSP兩種模式。SSP通過允許faster worker使用staled參數,從而達到平衡計算和網絡通信開銷時間的效果[8]。SSP每次迭代收斂變慢,但是每次迭代時間更短,在CPU集群上,SSP總體收斂速度比BSP更快,但是在GPU集群上訓練,BSP總體收斂速度比SSP反而快很多[6]。

BSP模型有個缺點,就是每次迭代結束,Worker需要發(fā)送梯度更新到PS,每次迭代開始,Worker需要從PS接收更新后的參數,這會造成瞬間大量的網絡傳輸。參數服務器通過把參數切分成block,并且shard到多臺機器,比較AllReduce,有效利用網絡帶寬,降低網絡延遲。目前主流的深度學習系統(tǒng)(Tensorflow,Mxnet,Petuum)都選擇用參數服務器做參數同步。

AllReduce(來自[5])

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Parameter Server

如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

上圖可以很容易看出,AllReduce拓撲中,Reducer節(jié)點成為網絡傳輸的瓶頸。PS拓撲中,通常每臺機器啟動相同數量的Worker和Parameter Server,每臺機器的網絡傳輸量基本相同。

ring AllReduce(來自[5])

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對于多機多卡訓練,可以把參數先在本機聚合,再指定一個worker跟參數服務器交互,可以大量減少網絡傳輸??梢允褂肞addlePaddle提出來的ring AllReduce,優(yōu)化單機多卡的本地聚合。

解決瞬間大量的網絡傳輸問題另一個方法是實現GPU計算和網絡通信的Overlap。在反向傳播的backward階段產生梯度時,可異步地進行梯度更新,并立即計算下一層網絡的梯度。梯度更新首先要把新梯度從GPU顯存拷貝到CPU內存,這種GPU-CPU的拷貝也可以和GPU計算做overlap。因為PS是跑在CPU上,所以GPU計算也跟PS參數更新實現Overlap。

GPU計算和網絡傳輸overlap(來自[1])

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  • 消除網絡瓶頸的方法(二)

減少網絡傳輸量也是消除網絡瓶頸的有效途徑。網絡模型中90%參數集中在FC層。很多深度學習系統(tǒng)提出了減少FC層參數大小的方法,比如Adam中的Sufficient Factor,CNTK中的1-bit quantization,Petuum中的Sufficient Factor Broadcasting[7]。

在PS拓撲中,每個worker需要發(fā)送梯度 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 和接收參數 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 。SFB通過 如何實現Tensorflow多機并行線性加速?如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 轉化為兩個低維度矩陣 如何實現Tensorflow多機并行線性加速?如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 的傳輸,并采用P2P拓撲,每個worker本地更新參數,避免了參數 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 的傳輸。SFB和PS比較如下:

PS和SFB(來自[1])

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(1)PS使用Master-Server架構,而SFB使用P2P架構,每個worker將 如何實現Tensorflow多機并行線性加速?如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 發(fā)送給所有其他worker,每個worker通過 如何實現Tensorflow多機并行線性加速?如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 在本地更新參數 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? ,從而避免了PS中 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 的傳輸。

(2)PS每個worker的傳輸數據量是固定的,SFB每個worker的傳輸數據量跟總worker數有關,每個worker需要把 如何實現Tensorflow多機并行線性加速?如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 發(fā)送給其他worker(發(fā)送numWorkers - 1次)。

(3)SFB傳輸數據量還跟batch size有關。在非凸有限和問題中

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在SGD中, 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 表示一個樣本,在mini-batch SGD中, 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? 表示batch size個樣本。

  • 實現代碼

首先得實現PS和SFB,可以參照petuum,ps-lite,angel。

Tensorflow 相關的修改主要有兩個地方:

tensorflow/core/kernels/http://training_ops.cc中的ApplyXXXOp(ApplyGradientDescentOp,ApplyAdagradOp,ApplyMomentumOp等),將本地的梯度更新修改為 發(fā)送 如何實現Tensorflow多機并行線性加速? ->PS端梯度更新->接收 如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

tensorflow/core/kernels/http://matmul_op.cc中的MalMulOp::Compute,這里需要判斷是否使用PS或者SFB,從而將本地更新切換為PS更新或SFB更新。

本地更新

如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

PS更新

如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

SFB更新

如何實現Tensorflow多機并行線性加速?

目前我們已經復現[1]中的實驗結果,實現了Tensorflow多機并行的線性加速。

參考文獻:

[1]   Hao Zhang, Zeyu Zheng, Shizhen Xu, Wei Dai, Qirong Ho, Xiaodan Liang, Zhiting Hu, Jinliang Wei, Pengtao Xie, Eric P. Xing. Poseidon: An Efficient Communication Architecture for Distributed Deep Learning on GPU Clusters. ATC 2017.

[2]   C. Sun, A. Shrivastava, S. Singh, and A. Gupta. Revisitingunreasonable effectiveness of data in deep learning era. In arXiv:1707.02968, 2017.

[3]   Azalia Mirhoseini, Hieu Pham, Quoc V Le, Benoit Steiner, Rasmus Larsen, Yuefeng Zhou, Naveen Kumar, Mohammad Norouzi, Samy Bengio, and Jeff Dean. 2017. Device placement optimization with reinforcement learning. In International Conference on Machine Learning (ICML).

[4]   PowerAI DDL

[5] allreduce Bringing HPC Techniques to Deep Learning

[6]   H. Cui, H. Zhang, G. R. Ganger, P. B. Gibbons, and E. P. Xing. GeePS: Scalable deeplearning on distributed GPUs with a GPU-specialized parameter server. In Proceedings
of EuroSys, 2016.

[7]   XIE, P., KIM, J. K., ZHOU, Y., HO, Q., KUMAR, A., YU, Y., AND XING, E. Distributed Machine Learning via Sufficient Factor Broadcasting. In arXiv (2015).

[8]   HO, Q., CIPAR, J., CUI, H., KIM, J. K., LEE, S., GIBBONS, P. B., GIBSON, G. A., GANGER, G. R., AND XING, E. P. More Effective Distributed ML via a Stale Synchronous Parallel Parameter Server. In NIPS (2013).

[9]   Benchmarking State-of-the-Art Deep Learning Software Tools

[10]   NanoNets : How to use Deep Learning when you have Limited Data     

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